Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHBGP04278 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHBGP04278 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHBGP04278 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHBGP04278 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHBGP04278 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SHBGP04278 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHBGP04278 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHBGP04278 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHBGP04278 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHBGP04278 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHBGP04278 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHBGP04278 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHBGP04278 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHBGP04278 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHBGP04278 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHBGP04278 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHBGP04278 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHBGP04278 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHBGP04278 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHBGP04278 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHBGP04278 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHBGP04278 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHBGP04278 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHBGP04278 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHBGP04278 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHBGP04278 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHBGP04278 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHBGP04278 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHBGP04278 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHBGP04278 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHBGP04278 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHBGP04278 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHBGP04278 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHBGP04278 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHBGP04278 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHBGP04278 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHBGP04278 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHBGP04278 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHBGP04278 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHBGP04278 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHBGP04278 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHBGP04278 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHBGP04278 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHBGP04278 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHBGP04278 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHBGP04278 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHBGP04278 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHBGP04278 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHBGP04278 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHBGP04278 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHBGP04278 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHBGP04278 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHBGP04278 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHBGP04278 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHBGP04278 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHBGP04278 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHBGP04278 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHBGP04278 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHBGP04278 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHBGP04278 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHBGP04278 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHBGP04278 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHBGP04278 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHBGP04278 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SHBGP04278 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHBGP04278 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHBGP04278 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHBGP04278 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHBGP04278 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHBGP04278 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHBGP04278 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHBGP04278 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHBGP04278 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHBGP04278 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHBGP04278 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHBGP04278 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHBGP04278 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHBGP04278 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms