Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTRP02766 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTRP02766 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTRP02766 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTRP02766 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTRP02766 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTRP02766 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTRP02766 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTRP02766 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTRP02766 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTRP02766 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTRP02766 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTRP02766 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTRP02766 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTRP02766 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTRP02766 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTRP02766 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTRP02766 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTRP02766 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTRP02766 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTRP02766 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TTRP02766 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTRP02766 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTRP02766 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTRP02766 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTRP02766 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTRP02766 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTRP02766 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTRP02766 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTRP02766 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTRP02766 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTRP02766 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTRP02766 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TTRP02766 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TTRP02766 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TTRP02766 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TTRP02766 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTRP02766 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTRP02766 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTRP02766 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTRP02766 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TTRP02766 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTRP02766 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTRP02766 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTRP02766 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTRP02766 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTRP02766 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTRP02766 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTRP02766 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTRP02766 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TTRP02766 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTRP02766 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTRP02766 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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