Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA4FO95754 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA4FO95754 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA4FO95754 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA4FO95754 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms