Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGDSO95455 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGDSO95455 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGDSO95455 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGDSO95455 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGDSO95455 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGDSO95455 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGDSO95455 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGDSO95455 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGDSO95455 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGDSO95455 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGDSO95455 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGDSO95455 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGDSO95455 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGDSO95455 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGDSO95455 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGDSO95455 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGDSO95455 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGDSO95455 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGDSO95455 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGDSO95455 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGDSO95455 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGDSO95455 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGDSO95455 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGDSO95455 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGDSO95455 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGDSO95455 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGDSO95455 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGDSO95455 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGDSO95455 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGDSO95455 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGDSO95455 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGDSO95455 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGDSO95455 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGDSO95455 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGDSO95455 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGDSO95455 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGDSO95455 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGDSO95455 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGDSO95455 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGDSO95455 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGDSO95455 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGDSO95455 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGDSO95455 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGDSO95455 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGDSO95455 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGDSO95455 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGDSO95455 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGDSO95455 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGDSO95455 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGDSO95455 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGDSO95455 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGDSO95455 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGDSO95455 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGDSO95455 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGDSO95455 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGDSO95455 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGDSO95455 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGDSO95455 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TGDSO95455 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TGDSO95455 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TGDSO95455 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGDSO95455 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGDSO95455 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGDSO95455 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGDSO95455 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGDSO95455 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGDSO95455 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGDSO95455 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGDSO95455 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGDSO95455 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms