Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3DO95025 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3DO95025 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms