Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK1O94907 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK1O94907 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK1O94907 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK1O94907 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK1O94907 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK1O94907 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK1O94907 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK1O94907 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK1O94907 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK1O94907 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK1O94907 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK1O94907 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK1O94907 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK1O94907 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK1O94907 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK1O94907 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK1O94907 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK1O94907 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK1O94907 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK1O94907 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK1O94907 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DKK1O94907 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DKK1O94907 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DKK1O94907 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DKK1O94907 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DKK1O94907 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK1O94907 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK1O94907 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK1O94907 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK1O94907 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK1O94907 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK1O94907 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK1O94907 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK1O94907 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK1O94907 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK1O94907 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK1O94907 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK1O94907 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK1O94907 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK1O94907 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK1O94907 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK1O94907 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK1O94907 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK1O94907 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK1O94907 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK1O94907 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK1O94907 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK1O94907 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK1O94907 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK1O94907 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK1O94907 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK1O94907 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK1O94907 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK1O94907 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK1O94907 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK1O94907 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK1O94907 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK1O94907 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK1O94907 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DKK1O94907 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK1O94907 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK1O94907 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK1O94907 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK1O94907 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK1O94907 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK1O94907 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK1O94907 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DKK1O94907 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK1O94907 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK1O94907 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK1O94907 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK1O94907 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK1O94907 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK1O94907 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DKK1O94907 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DKK1O94907 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK1O94907 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK1O94907 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK1O94907 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK1O94907 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK1O94907 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK1O94907 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DKK1O94907 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK1O94907 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK1O94907 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK1O94907 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK1O94907 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK1O94907 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms