Protein–RNA interactions for Protein: O94850

DDN, Dendrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDNO94850 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DDNO94850 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDNO94850 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDNO94850 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DDNO94850 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDNO94850 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDNO94850 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDNO94850 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDNO94850 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDNO94850 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDNO94850 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDNO94850 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDNO94850 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDNO94850 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDNO94850 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDNO94850 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDNO94850 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDNO94850 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDNO94850 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDNO94850 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDNO94850 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDNO94850 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDNO94850 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDNO94850 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDNO94850 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDNO94850 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DDNO94850 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDNO94850 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDNO94850 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDNO94850 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDNO94850 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDNO94850 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDNO94850 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDNO94850 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDNO94850 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDNO94850 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDNO94850 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDNO94850 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDNO94850 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDNO94850 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDNO94850 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DDNO94850 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDNO94850 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDNO94850 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DDNO94850 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDNO94850 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDNO94850 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDNO94850 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDNO94850 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDNO94850 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDNO94850 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDNO94850 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDNO94850 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDNO94850 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDNO94850 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDNO94850 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDNO94850 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDNO94850 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDNO94850 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DDNO94850 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DDNO94850 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDNO94850 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDNO94850 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDNO94850 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDNO94850 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDNO94850 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDNO94850 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDNO94850 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDNO94850 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDNO94850 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDNO94850 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDNO94850 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDNO94850 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDNO94850 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDNO94850 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDNO94850 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDNO94850 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDNO94850 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDNO94850 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDNO94850 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms