Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP1O94782 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP1O94782 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP1O94782 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP1O94782 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP1O94782 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP1O94782 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP1O94782 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP1O94782 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP1O94782 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP1O94782 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP1O94782 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP1O94782 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP1O94782 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP1O94782 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP1O94782 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP1O94782 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP1O94782 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP1O94782 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP1O94782 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP1O94782 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP1O94782 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP1O94782 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP1O94782 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP1O94782 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP1O94782 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP1O94782 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP1O94782 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP1O94782 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP1O94782 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP1O94782 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP1O94782 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP1O94782 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP1O94782 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP1O94782 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP1O94782 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP1O94782 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP1O94782 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP1O94782 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP1O94782 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP1O94782 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP1O94782 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP1O94782 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP1O94782 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP1O94782 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP1O94782 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP1O94782 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP1O94782 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP1O94782 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP1O94782 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP1O94782 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP1O94782 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP1O94782 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP1O94782 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP1O94782 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP1O94782 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP1O94782 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP1O94782 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP1O94782 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP1O94782 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms