Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALMO75781 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PALMO75781 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PALMO75781 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALMO75781 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALMO75781 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALMO75781 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALMO75781 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALMO75781 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALMO75781 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALMO75781 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PALMO75781 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALMO75781 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PALMO75781 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALMO75781 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMO75781 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMO75781 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMO75781 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMO75781 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMO75781 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMO75781 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMO75781 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMO75781 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMO75781 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMO75781 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALMO75781 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALMO75781 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALMO75781 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALMO75781 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALMO75781 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALMO75781 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALMO75781 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALMO75781 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PALMO75781 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALMO75781 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALMO75781 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMO75781 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALMO75781 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PALMO75781 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALMO75781 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALMO75781 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALMO75781 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALMO75781 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALMO75781 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALMO75781 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALMO75781 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALMO75781 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PALMO75781 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALMO75781 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALMO75781 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMO75781 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMO75781 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMO75781 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMO75781 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMO75781 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMO75781 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMO75781 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMO75781 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMO75781 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMO75781 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms