Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMUO75648 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMUO75648 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMUO75648 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMUO75648 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMUO75648 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMUO75648 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMUO75648 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMUO75648 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMUO75648 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMUO75648 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMUO75648 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMUO75648 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMUO75648 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMUO75648 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMUO75648 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMUO75648 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMUO75648 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMUO75648 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMUO75648 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMUO75648 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMUO75648 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMUO75648 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMUO75648 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMUO75648 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMUO75648 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMUO75648 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMUO75648 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMUO75648 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMUO75648 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMUO75648 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMUO75648 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMUO75648 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMUO75648 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMUO75648 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMUO75648 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMUO75648 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMUO75648 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMUO75648 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMUO75648 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMUO75648 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMUO75648 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMUO75648 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMUO75648 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMUO75648 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMUO75648 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMUO75648 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMUO75648 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMUO75648 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMUO75648 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMUO75648 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMUO75648 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMUO75648 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms