Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH16O75452 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH16O75452 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH16O75452 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH16O75452 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH16O75452 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH16O75452 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH16O75452 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH16O75452 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH16O75452 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH16O75452 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH16O75452 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH16O75452 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH16O75452 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH16O75452 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH16O75452 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH16O75452 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH16O75452 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH16O75452 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH16O75452 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH16O75452 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH16O75452 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH16O75452 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH16O75452 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH16O75452 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH16O75452 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDH16O75452 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH16O75452 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH16O75452 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH16O75452 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH16O75452 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH16O75452 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH16O75452 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH16O75452 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH16O75452 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH16O75452 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH16O75452 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH16O75452 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH16O75452 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH16O75452 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH16O75452 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH16O75452 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH16O75452 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH16O75452 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH16O75452 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH16O75452 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH16O75452 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RDH16O75452 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH16O75452 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH16O75452 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH16O75452 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH16O75452 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH16O75452 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms