Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPFIA3O75145 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms