Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPXNO60711 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPXNO60711 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPXNO60711 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPXNO60711 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPXNO60711 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPXNO60711 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPXNO60711 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPXNO60711 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPXNO60711 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPXNO60711 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPXNO60711 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPXNO60711 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPXNO60711 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPXNO60711 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPXNO60711 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPXNO60711 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LPXNO60711 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LPXNO60711 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPXNO60711 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPXNO60711 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPXNO60711 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPXNO60711 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPXNO60711 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPXNO60711 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPXNO60711 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPXNO60711 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPXNO60711 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPXNO60711 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPXNO60711 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPXNO60711 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPXNO60711 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPXNO60711 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPXNO60711 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPXNO60711 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPXNO60711 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPXNO60711 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LPXNO60711 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPXNO60711 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LPXNO60711 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPXNO60711 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPXNO60711 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPXNO60711 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPXNO60711 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPXNO60711 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPXNO60711 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPXNO60711 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPXNO60711 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPXNO60711 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPXNO60711 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPXNO60711 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPXNO60711 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPXNO60711 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPXNO60711 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPXNO60711 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPXNO60711 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LPXNO60711 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPXNO60711 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPXNO60711 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPXNO60711 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPXNO60711 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPXNO60711 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPXNO60711 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPXNO60711 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPXNO60711 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPXNO60711 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPXNO60711 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPXNO60711 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPXNO60711 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPXNO60711 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPXNO60711 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms