Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5O60239 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5O60239 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5O60239 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5O60239 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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