Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT86O43790 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT86O43790 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT86O43790 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT86O43790 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT86O43790 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT86O43790 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT86O43790 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT86O43790 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT86O43790 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT86O43790 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT86O43790 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT86O43790 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT86O43790 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT86O43790 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT86O43790 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT86O43790 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT86O43790 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT86O43790 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT86O43790 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT86O43790 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT86O43790 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT86O43790 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT86O43790 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT86O43790 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT86O43790 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT86O43790 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT86O43790 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT86O43790 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT86O43790 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT86O43790 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT86O43790 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT86O43790 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT86O43790 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT86O43790 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT86O43790 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT86O43790 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT86O43790 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT86O43790 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT86O43790 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT86O43790 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT86O43790 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT86O43790 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT86O43790 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT86O43790 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT86O43790 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT86O43790 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT86O43790 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT86O43790 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT86O43790 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT86O43790 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT86O43790 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT86O43790 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT86O43790 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT86O43790 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT86O43790 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT86O43790 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT86O43790 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT86O43790 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT86O43790 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT86O43790 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT86O43790 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT86O43790 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT86O43790 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT86O43790 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT86O43790 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT86O43790 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT86O43790 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms