Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGTAO43765 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGTAO43765 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGTAO43765 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGTAO43765 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGTAO43765 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGTAO43765 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGTAO43765 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGTAO43765 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGTAO43765 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SGTAO43765 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGTAO43765 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGTAO43765 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGTAO43765 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGTAO43765 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGTAO43765 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGTAO43765 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGTAO43765 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGTAO43765 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGTAO43765 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGTAO43765 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGTAO43765 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGTAO43765 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGTAO43765 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGTAO43765 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTAO43765 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTAO43765 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTAO43765 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTAO43765 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTAO43765 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTAO43765 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTAO43765 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTAO43765 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTAO43765 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTAO43765 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTAO43765 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTAO43765 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTAO43765 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTAO43765 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTAO43765 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTAO43765 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTAO43765 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTAO43765 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTAO43765 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTAO43765 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTAO43765 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTAO43765 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTAO43765 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTAO43765 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTAO43765 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTAO43765 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTAO43765 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTAO43765 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTAO43765 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTAO43765 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTAO43765 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTAO43765 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTAO43765 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTAO43765 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTAO43765 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTAO43765 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTAO43765 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTAO43765 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTAO43765 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTAO43765 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTAO43765 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGTAO43765 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGTAO43765 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGTAO43765 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGTAO43765 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTAO43765 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTAO43765 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTAO43765 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTAO43765 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTAO43765 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTAO43765 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTAO43765 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTAO43765 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGTAO43765 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGTAO43765 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGTAO43765 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGTAO43765 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTAO43765 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTAO43765 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTAO43765 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTAO43765 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTAO43765 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTAO43765 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms