Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC3O43617 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3O43617 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms