Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBX1O43435 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBX1O43435 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBX1O43435 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBX1O43435 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBX1O43435 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBX1O43435 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBX1O43435 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBX1O43435 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBX1O43435 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBX1O43435 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TBX1O43435 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBX1O43435 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBX1O43435 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TBX1O43435 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TBX1O43435 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBX1O43435 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBX1O43435 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBX1O43435 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBX1O43435 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBX1O43435 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBX1O43435 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBX1O43435 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TBX1O43435 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBX1O43435 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBX1O43435 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBX1O43435 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TBX1O43435 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TBX1O43435 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TBX1O43435 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBX1O43435 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBX1O43435 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBX1O43435 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBX1O43435 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBX1O43435 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBX1O43435 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBX1O43435 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBX1O43435 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBX1O43435 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBX1O43435 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBX1O43435 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.2 ms