Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIAH2O43255 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIAH2O43255 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIAH2O43255 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms