Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PJA2O43164 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA2O43164 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA2O43164 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA2O43164 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA2O43164 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA2O43164 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PJA2O43164 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PJA2O43164 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA2O43164 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA2O43164 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA2O43164 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA2O43164 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA2O43164 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PJA2O43164 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA2O43164 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA2O43164 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA2O43164 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA2O43164 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA2O43164 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA2O43164 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PJA2O43164 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA2O43164 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA2O43164 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA2O43164 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA2O43164 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA2O43164 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA2O43164 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PJA2O43164 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PJA2O43164 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PJA2O43164 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PJA2O43164 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PJA2O43164 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PJA2O43164 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PJA2O43164 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PJA2O43164 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PJA2O43164 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PJA2O43164 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PJA2O43164 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PJA2O43164 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PJA2O43164 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PJA2O43164 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PJA2O43164 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PJA2O43164 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PJA2O43164 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PJA2O43164 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PJA2O43164 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PJA2O43164 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PJA2O43164 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PJA2O43164 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PJA2O43164 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PJA2O43164 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PJA2O43164 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PJA2O43164 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PJA2O43164 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PJA2O43164 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PJA2O43164 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PJA2O43164 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PJA2O43164 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PJA2O43164 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PJA2O43164 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PJA2O43164 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PJA2O43164 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PJA2O43164 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PJA2O43164 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PJA2O43164 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PJA2O43164 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PJA2O43164 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PJA2O43164 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PJA2O43164 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PJA2O43164 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PJA2O43164 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PJA2O43164 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PJA2O43164 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PJA2O43164 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PJA2O43164 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PJA2O43164 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PJA2O43164 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PJA2O43164 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PJA2O43164 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms