Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHADO15335 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHADO15335 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHADO15335 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHADO15335 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHADO15335 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHADO15335 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHADO15335 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHADO15335 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHADO15335 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHADO15335 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHADO15335 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHADO15335 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHADO15335 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHADO15335 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHADO15335 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHADO15335 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHADO15335 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHADO15335 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHADO15335 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHADO15335 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHADO15335 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHADO15335 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHADO15335 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHADO15335 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHADO15335 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHADO15335 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHADO15335 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHADO15335 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHADO15335 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHADO15335 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHADO15335 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHADO15335 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHADO15335 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHADO15335 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHADO15335 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHADO15335 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHADO15335 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHADO15335 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHADO15335 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHADO15335 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHADO15335 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHADO15335 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHADO15335 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHADO15335 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHADO15335 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHADO15335 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHADO15335 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHADO15335 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHADO15335 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHADO15335 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHADO15335 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHADO15335 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHADO15335 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHADO15335 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHADO15335 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHADO15335 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHADO15335 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHADO15335 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHADO15335 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHADO15335 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHADO15335 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHADO15335 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHADO15335 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHADO15335 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHADO15335 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHADO15335 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHADO15335 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHADO15335 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHADO15335 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHADO15335 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHADO15335 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHADO15335 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHADO15335 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHADO15335 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHADO15335 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHADO15335 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHADO15335 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHADO15335 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHADO15335 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHADO15335 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHADO15335 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHADO15335 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHADO15335 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHADO15335 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHADO15335 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHADO15335 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHADO15335 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHADO15335 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHADO15335 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHADO15335 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHADO15335 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHADO15335 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHADO15335 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHADO15335 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHADO15335 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHADO15335 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHADO15335 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms