Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB6O15197 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms