Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VILLO15195 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VILLO15195 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VILLO15195 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VILLO15195 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VILLO15195 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VILLO15195 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VILLO15195 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VILLO15195 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VILLO15195 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VILLO15195 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VILLO15195 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VILLO15195 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VILLO15195 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VILLO15195 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VILLO15195 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VILLO15195 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VILLO15195 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VILLO15195 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VILLO15195 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VILLO15195 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VILLO15195 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VILLO15195 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VILLO15195 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VILLO15195 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VILLO15195 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VILLO15195 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VILLO15195 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VILLO15195 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VILLO15195 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VILLO15195 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VILLO15195 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VILLO15195 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VILLO15195 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VILLO15195 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VILLO15195 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VILLO15195 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VILLO15195 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VILLO15195 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VILLO15195 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VILLO15195 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VILLO15195 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VILLO15195 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VILLO15195 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VILLO15195 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VILLO15195 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VILLO15195 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VILLO15195 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VILLO15195 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VILLO15195 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VILLO15195 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VILLO15195 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VILLO15195 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VILLO15195 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VILLO15195 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VILLO15195 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VILLO15195 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VILLO15195 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VILLO15195 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VILLO15195 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VILLO15195 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VILLO15195 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VILLO15195 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VILLO15195 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VILLO15195 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VILLO15195 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VILLO15195 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VILLO15195 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VILLO15195 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VILLO15195 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VILLO15195 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VILLO15195 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VILLO15195 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VILLO15195 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VILLO15195 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VILLO15195 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VILLO15195 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VILLO15195 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VILLO15195 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VILLO15195 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VILLO15195 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VILLO15195 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms