Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIPC1O14908 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GIPC1O14908 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GIPC1O14908 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms