Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDC80O14777 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDC80O14777 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDC80O14777 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDC80O14777 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDC80O14777 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC80O14777 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC80O14777 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC80O14777 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC80O14777 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC80O14777 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC80O14777 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC80O14777 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC80O14777 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDC80O14777 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDC80O14777 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC80O14777 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC80O14777 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC80O14777 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC80O14777 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC80O14777 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC80O14777 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDC80O14777 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC80O14777 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC80O14777 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC80O14777 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC80O14777 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC80O14777 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDC80O14777 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC80O14777 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC80O14777 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC80O14777 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC80O14777 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC80O14777 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC80O14777 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC80O14777 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC80O14777 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDC80O14777 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDC80O14777 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NDC80O14777 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDC80O14777 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDC80O14777 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDC80O14777 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDC80O14777 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDC80O14777 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC80O14777 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC80O14777 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC80O14777 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC80O14777 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC80O14777 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDC80O14777 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC80O14777 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC80O14777 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC80O14777 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDC80O14777 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC80O14777 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC80O14777 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC80O14777 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC80O14777 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC80O14777 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC80O14777 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDC80O14777 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDC80O14777 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms