Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD2O00469 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLOD2O00469 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms