Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAPO00193 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAPO00193 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAPO00193 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAPO00193 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAPO00193 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAPO00193 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAPO00193 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAPO00193 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAPO00193 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAPO00193 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAPO00193 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAPO00193 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAPO00193 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAPO00193 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAPO00193 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAPO00193 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAPO00193 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAPO00193 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAPO00193 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAPO00193 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAPO00193 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAPO00193 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAPO00193 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAPO00193 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAPO00193 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAPO00193 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAPO00193 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAPO00193 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAPO00193 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAPO00193 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAPO00193 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAPO00193 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAPO00193 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAPO00193 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAPO00193 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAPO00193 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAPO00193 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAPO00193 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAPO00193 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAPO00193 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAPO00193 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAPO00193 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAPO00193 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAPO00193 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAPO00193 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAPO00193 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAPO00193 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAPO00193 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAPO00193 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAPO00193 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAPO00193 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAPO00193 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAPO00193 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAPO00193 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAPO00193 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAPO00193 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAPO00193 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAPO00193 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAPO00193 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAPO00193 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMAPO00193 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAPO00193 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAPO00193 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAPO00193 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAPO00193 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAPO00193 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAPO00193 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAPO00193 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAPO00193 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms