Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC01387J3KSC0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC01387J3KSC0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC01387J3KSC0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms