Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1D1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1D1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1D1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1D1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1D1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
H7C1D1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
H7C1D1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
H7C1D1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1D1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1D1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1D1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1D1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1D1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1D1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1D1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1D1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1D1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1D1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1D1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1D1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1D1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1D1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1D1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1D1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1D1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1D1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
H7C1D1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H7C1D1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
H7C1D1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
H7C1D1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1D1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1D1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1D1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1D1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
H7C1D1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1D1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1D1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1D1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1D1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1D1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1D1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1D1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1D1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1D1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1D1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1D1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1D1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1D1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1D1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1D1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1D1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1D1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1D1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1D1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1D1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1D1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1D1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1D1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
H7C1D1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
H7C1D1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
H7C1D1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
H7C1D1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
H7C1D1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1D1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1D1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1D1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1D1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1D1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1D1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1D1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1D1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1D1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1D1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1D1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1D1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1D1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1D1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1D1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1D1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1D1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1D1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1D1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
H7C1D1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1D1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1D1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1D1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1D1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1D1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H7C1D1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1D1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms