Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5BA8MYB1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO5BA8MYB1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5BA8MYB1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms