Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00473A8K010 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00473A8K010 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms