Protein–RNA interactions for Protein: A7E2V4

ZSWIM8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM8A7E2V4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZSWIM8A7E2V4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZSWIM8A7E2V4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZSWIM8A7E2V4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZSWIM8A7E2V4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZSWIM8A7E2V4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZSWIM8A7E2V4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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