Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX2A6NKB5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX2A6NKB5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms