Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8B2A6NJW9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD8B2A6NJW9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms