Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L3A6NCW0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L3A6NCW0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L3A6NCW0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms