Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00862A6NCI5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00862A6NCI5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms