Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MAP1LC3B2A6NCE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3B2A6NCE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms