Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A4D1N5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A4D1N5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A4D1N5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4D1N5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A4D1N5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4D1N5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4D1N5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4D1N5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4D1N5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A4D1N5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4D1N5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4D1N5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4D1N5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4D1N5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4D1N5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4D1N5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4D1N5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A4D1N5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4D1N5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4D1N5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A4D1N5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
A4D1N5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A4D1N5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A4D1N5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A4D1N5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms