Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPDC1A2A3K4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPDC1A2A3K4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPDC1A2A3K4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms