Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC26A0AVF1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC26A0AVF1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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