Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms