Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0U1RQF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0U1RQF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQF3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms