Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZDHHC9Q9Y397 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZDHHC9Q9Y397 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms