Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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UBE2J1Q9Y385 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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UBE2J1Q9Y385 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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UBE2J1Q9Y385 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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UBE2J1Q9Y385 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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UBE2J1Q9Y385 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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UBE2J1Q9Y385 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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UBE2J1Q9Y385 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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