Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED16Q9Y2X0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms