Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1BQ9UPS6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms