Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB23Q9ULC3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms