Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.3 ms