Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms