Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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