Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTLNQ9NXG0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms